Το Εργαστήριο Οργάνωσης και Διοίκησης Επιχειρήσεων του Αγροτικού Χώρου, ξεκίνησε να λειτουργεί θεσμοθετημένο το 2003. Αποστολή του είναι η διερεύνηση των σύνθετων ζητημάτων της σύγχρονης επιχειρηματικότητας και η μελέτη των παραγόντων που την διαμορφώνουν με εστίαση στον κλάδο τροφίμων. Για τον σκοπό αυτό, το εργαστήριο διεξάγει έρευνες που καλύπτουν ζητήματα τόσο των επιχειρήσεων τροφίμων όσο και των επιχειρήσεων όλων των κλάδων γενικότερα, όπως:

• Διοικητική μάρκετινγκ επιχειρήσεων αγροδιατροφικού κλάδου
• Συμπεριφορά καταναλωτή
• Μάρκετινγκ και βιώσιμη ανάπτυξη 
• Σπατάλη Τροφίμων
• Στρατηγική ανταγωνισμού και αποτελεσματικότητα της επιχείρησης
• Βαθμός εξωστρέφειας επιχειρήσεων, συνεταιρισμών και ομάδων παραγωγών
• Κίνητρα/στόχοι και πρακτικές επιχειρηματικότητας
• Παράγοντες υποστήριξης και ανάπτυξης της επιχειρηματικότητας
• Επιχειρηματική καινοτομία και ανταγωνιστικότητα
• Διοίκηση ολικής ποιότητας και επιχειρηματική αριστεία
• Συστήματα διαχείρισης ποιότητας 
• Εργαλεία και τεχνικές βελτίωσης της ποιότητας
• Συστάδες (cluster) επιχειρήσεων και περιφερειακή/τοπική οικονομία
• Επιχειρηματικές πρακτικές απασχόλησης και διοίκηση ανθρώπινου δυναμικού
• Συστήματα επιχειρηματικής ευφυΐας
• Εφαρμογή ευφυών πληροφοριακών συστημάτων  στη βελτιστοποίηση πόρων, στη βελτίωση επιχειρησιακών διαδικασιών και στη μοντελοποίηση δυναμικών επιχειρησιακών συστημάτων
• Συνεχιζόμενη επαγγελματική εκπαίδευση και κατάρτιση σε οργανισμούς και επιχειρήσεις
• Διερεύνηση επιμορφωτικών αναγκών, ανάπτυξη και αναβάθμιση δεξιοτήτων του ανθρώπινου δυναμικού
• Σχεδίαση, ανάπτυξη και εφαρμογή αλγορίθμων υπολογιστικής νοημοσύνης
• Σχεδίαση, ανάπτυξη και εφαρμογή ευφυών αλγορίθμων υπολογιστικής νοημοσύνης

Στο πλαίσιο αυτό, το εργαστήριο δραστηριοποιείται σε συναφή ερευνητικά πεδία και χρηματοδοτούμενα προγράμματα – εθνικά, ευρωπαϊκά και διεθνή – όπου εκπονούνται αντίστοιχα διδακτορικές και μεταδιδακτορικές έρευνες, μεταπτυχιακές και προπτυχιακές διπλωματικές εργασίες. Το εργαστήριο υποστηρίζει ενεργά τους φοιτητές  του προγράμματος μεταπτυχιακών σπουδών «Διοίκηση Επιχειρήσεων Τροφίμων - ΜΒΑ» οι οποίοι διεξάγουν έρευνα με σκοπό τη συγγραφή διπλωματικής εργασίας που απαιτείται για την απόκτηση του μεταπτυχιακού τους τίτλου.